LS-DYNA 于Linux系统连接的脚本文件

schuhi

第一种情况：采用shell编写个PBS脚本，想实现与学校Linux系统的连接，从而调用LS-DYNA 计算。可是遇到了问题。我先查看了系统可以使用的LS-DYNA modulue，总共有5个，因为ls-dyna/971_R5_1_1_amd这个是默认的，所以我就调用这个
ls-dyna/971.R6.1.0
ls-dyna/971.R7.0.0
ls-dyna/971_R4_2_1_amd
ls-dyna/971_R5_1_1_amd(default)
ls-dyna/971_R5_1_1_intel

我调用这个默认的，如下：
chuq@lyra04:~/explosive> module load ls-dyna
Lyra: LS-Dyna (971) Build R5_1_1_amd module loaded.
To use the lscasedriver utility,  
add the alias command below to your batch script
and run the utility with the command,
lscasedriver [-k] infile execute
alias lscasedriver='python /pkg/suse11/lsdyna/971_R5_1_1_amd/lscasedriver.py'

shell出现几行语句，意思是当我加载这个modulue时，需要加上lscasedriver等语句。我不知道怎么在我的脚本中加，尤其是 lscasedriver [-k] infile execute 这一句，哪位可以帮我解释一下。非常感谢。。。。
第一种情况的脚本如下：
#!/bin/bash -l

#PBS -N explosive002
#PBS -l walltime=10:00:00
#PBS -l select=1:ncpus=12:mpiprocs=12:mem=16gb:cputype=E5-2680v2
#PBS -j oe
module load ls-dyna/971_R5_1_1_amd
cd ~/try002
alias lscasedriver='python/pkg/suse11/lsdyna/971_R5_1_1_amd/lscasedriver.py'
lscasedriver -k ep.k
ls-dyna i=ep.k

第二种情况：

我没有使用软件默认的模块，我选择了ls-dyna/971.R6.1.0这一个，然后我就把lscasedriver [-k] infile execute
alias lscasedriver='python /pkg/suse11/lsdyna/971_R5_1_1_amd/lscasedriver.py'这两句删除了，修改后的脚本如下，可是还是出错了，提示最后一句“ls-dyna i=ep.k”无法执行。（/var/spool/PBS/mom_priv/jobs/1095252.pbs.SC: line 13: ls-dyna: command not found）第二种情况的脚本如下：
#!/bin/bash -l

#PBS -N explosive002
#PBS -l walltime=10:00:00
#PBS -l select=1:ncpus=12:mpiprocs=12:mem=16gb:cputype=E5-2680v2
#PBS -j oe
module load ls-dyna/971.R6.1.0
cd ~/try003
ls-dyna i=ep.k


我写的脚本也是参考网上别人的，但是我不知道怎么修改了，各位帮我看看，我应该怎么修改我的脚本。谢谢啊

schuhi

学校未买并行模式的LS-DYNA求解器，只有共享内存的。关于单机多核形式，脚本如下：
#!/bin/bash -l
#PBS -N ex
#PBS -l walltime=24:00:00
#PBS -j oe
module load ls-dyna/971.R7.0.0
export OMP_NUM_THREADS=5
cd ~/sx/10
lsdyna_d i=10.k ncpu=5 memory=67200000

SPH节点约43万，计算时间约12h，未使用质量缩放，时间步长0.9