PBS提交Nx nastran问题

Foil

有没有Altair的兄弟？
单位的计算资源是基于rh linux cluster的，整个cluster是通过PBS对硬件资源进行管理的，而且IT人员仅仅开放了SSH登录，不允许rsh，请问如何设置才能通过PBS提交进行多CPU计算呢？

linuaries

这个比较复杂，建议你还是直接电话或者email给Altair吧

Foil

不知道下面脚本行不行，懂的人帮忙看看

#!/bin/ksh
# pbs_nast: PBS script to use with NX Nastran and HP-MPI
# Usage: qsub -lnodes=Number-Of-Nodes pbs-nast
# Assume the data file is located in the directory whence the qsub
# command was issued.
#
dat=$PBS_O_WORKDIR/xxx.dat
jobdat=${dat##*/}
# 定义工作目录
TMPDIR=/scratch
cd $TMPDIR
# 拷贝数据
rcp $PBS_O_HOSTdat .
# 定义并行CPU数目
dmparallel=$(sed -n -e '$=' $PBS_NODEFILE)
#主机关键字
hostskwd=`sed -e :a -e '/$/N; s/\n/:/; ta' $PBS_NODEFILE`

hg_boy

比较高级的话题。
有了经验了，别忘了上来交流交流。

lfzhu

HP-MPI 缺省用ssh。用rsh需要特殊设置

下面是我的部分脚本，我可以在PBS+HPMPI上运行。你需要修改一下，最后用mpirun -f appfile 或者用 mpiexec 运行

#output the nodes used to run parallel OS
#$PBS_NODEFILE=/var/spool/PBS/aux/461.iceland
echo "cat $PBS_NODEFILE===="
cat $PBS_NODEFILE

#$PBS_O_WORKDIR=/home/lzhu
WORKDIR=$PBS_O_WORKDIR
echo "cd $WORKDIR===="
cd $WORKDIR


#$NODEFILE=/home/lzhu/461.iceland
NODEFILE=${PBS_NODEFILE##*/}
cp $PBS_NODEFILE $NODEFILE
sed -i "s;\(.*\);\1WORKDIR;" $NODEFILE
echo "cat $NODEFILE===="
cat $NODEFILE

肚皮猫

通常现在都会关闭rsh服务，由于安全的原因，其实ssh和rsh对用户来说应该没什么影响吧，无非就是调用时环境变量设置一下即可，另外nastran提交给你个简单例子
#PBS -N nastran
#PBS -lselect=1:ncpus=1:mpiprocs=1
cd $PBS_O_WORKDIR
/software/msc/nastran/bin/nast2008 input.bdf

暖风

比较高级的话题。

hunkth

有点复杂呢！！！

fvicth64

回贴才厚道,厚道就回贴。